La Zona de Amortiguación, es la Zona Reservada del Manu, es una zona tampón o de amortiguamiento de la Reserva de Biosfera del Manu. Constituye también un área natural protegida ligada en su administración y manejo al Parque Nacional del Manu, por lo que es considerada estratégicamente como una unidad de conservación. Ha sido zonificada para el uso turístico y la investigación. Zona de Transición o Zona de Uso Múltiple, es la Zona Cultural, donde existen asentamientos humanos (generalmente colonos de origen serrano), quienes vienen adquiriendo mayor conciencia de su ubicación y participan activamente en proyectos de desarrollo sostenible. Ambas áreas, el Parque Nacional y la Zona Reservada, más algunas áreas de dominio público fueron reconocidas por la UNESCO  como Reserva de Biósfera del Manu. En diciembre de 1987 el Parque Nacional del Manu fue incluido en la lista de Patrimonio Mundial.

Gracias a su aislamiento natural, el Manu alberga muchas especies consideradas en peligro de extinción a nivel nacional y mundial, como el jaguar, el oso de anteojos, el lobo de río y los lagartos blanco y negro. Se considera que alberga la más grande y variada biodiversidad existente en el planeta.